Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms