Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZBED6P86452 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZBED6P86452 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms