Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HERVK_113P63132 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms