Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPD2P43304 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms