Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETV4P43268 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV4P43268 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms