Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PCGF2P35227 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PCGF2P35227 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PCGF2P35227 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PCGF2P35227 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCGF2P35227 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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