Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFNP31947 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFNP31947 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFNP31947 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms