Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms