Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECHS1P30084 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHS1P30084 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms