Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms