Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms