Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms