Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms