Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AMY2BP19961 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms