Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMD1P17707 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms