Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CCL3L1P16619 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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