Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NME1P15531 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NME1P15531 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NME1P15531 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NME1P15531 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME1P15531 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME1P15531 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms