Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHGAP10645 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHGAP10645 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHGAP10645 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHGAP10645 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHGAP10645 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHGAP10645 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms