Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBP07199 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBP07199 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBP07199 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBP07199 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms