Protein–RNA interactions for Protein: O94850

DDN, Dendrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDNO94850 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DDNO94850 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DDNO94850 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DDNO94850 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DDNO94850 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms