Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms