Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms