Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRICKLE3O43900 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms