Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATMINO43313 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATMINO43313 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATMINO43313 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms