Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms