Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms