Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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