Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC78A2IDD5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms