Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP3Q9Y6F1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP3Q9Y6F1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PARP3Q9Y6F1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PARP3Q9Y6F1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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