Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y4

PYGO1, Pygopus homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO1Q9Y3Y4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PYGO1Q9Y3Y4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PYGO1Q9Y3Y4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms