Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED3Q9Y3Q3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms