Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIT1Q9Y3P8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIT1Q9Y3P8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIT1Q9Y3P8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms