Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
YBX2Q9Y2T7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
YBX2Q9Y2T7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YBX2Q9Y2T7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms