Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP20Q9Y2K6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP20Q9Y2K6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP20Q9Y2K6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms