Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCE1Q9Y256 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RCE1Q9Y256 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCE1Q9Y256 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms