Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP2BQ9UQN3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms