Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HDAC5Q9UQL6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HDAC5Q9UQL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC5Q9UQL6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms