Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SHANK2Q9UPX8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SHANK2Q9UPX8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SHANK2Q9UPX8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHANK2Q9UPX8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms