Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM35Q9UPQ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM35Q9UPQ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM35Q9UPQ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM35Q9UPQ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms