Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX7Q9UNH6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX7Q9UNH6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX7Q9UNH6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms