Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP18Q9UMW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP18Q9UMW8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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