Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN11Q9UMQ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN11Q9UMQ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN11Q9UMQ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms