Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCC3Q9ULS5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC3Q9ULS5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCC3Q9ULS5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms