Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MED23Q9ULK4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MED23Q9ULK4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MED23Q9ULK4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MED23Q9ULK4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms