Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALD1Q9ULE6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALD1Q9ULE6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PALD1Q9ULE6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PALD1Q9ULE6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALD1Q9ULE6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALD1Q9ULE6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms