Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL25

RAB21, Ras-related protein Rab-21, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB21Q9UL25 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB21Q9UL25 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB21Q9UL25 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms