Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CHIC2Q9UKJ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHIC2Q9UKJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CHIC2Q9UKJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHIC2Q9UKJ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms