Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDKN2A-AS1Q9UH64 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms