Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK1Q9NYA1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK1Q9NYA1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms