Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPP4R2Q9NY27 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPP4R2Q9NY27 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPP4R2Q9NY27 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPP4R2Q9NY27 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPP4R2Q9NY27 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PPP4R2Q9NY27 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PPP4R2Q9NY27 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms